Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms