Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms