Protein–RNA interactions for Protein: P30275

Ckmt1, Creatine kinase U-type, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckmt1P30275 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckmt1P30275 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms