Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms