Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col2a1P28481 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col2a1P28481 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col2a1P28481 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col2a1P28481 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col2a1P28481 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col2a1P28481 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col2a1P28481 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col2a1P28481 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col2a1P28481 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col2a1P28481 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms