Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja4P28235 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms