Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms