Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BrafP28028 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BrafP28028 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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BrafP28028 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BrafP28028 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BrafP28028 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BrafP28028 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BrafP28028 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BrafP28028 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BrafP28028 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BrafP28028 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BrafP28028 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BrafP28028 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BrafP28028 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BrafP28028 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BrafP28028 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BrafP28028 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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