Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms