Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo2P25801 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms