Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tctex1d2-202ENSMUST00000080316 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 AC117608.1-202ENSMUST00000224074 1049 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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