Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PparaP23204 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PparaP23204 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PparaP23204 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PparaP23204 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PparaP23204 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PparaP23204 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PparaP23204 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms