Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms