Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SftpcP21841 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SftpcP21841 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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