Protein–RNA interactions for Protein: P21761

Trhr, Thyrotropin-releasing hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhrP21761 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrhrP21761 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhrP21761 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhrP21761 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrhrP21761 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms