Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lmnb2P21619 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms