Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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