Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms