Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VimP20152 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VimP20152 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VimP20152 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VimP20152 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VimP20152 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VimP20152 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VimP20152 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VimP20152 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VimP20152 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms