Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NelfeP19426 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms