Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms