Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RargP18911 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RargP18911 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RargP18911 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RargP18911 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RargP18911 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RargP18911 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms