Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18525 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18525 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18525 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18525 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18525 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18525 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18525 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18525 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18525 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms