Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18524 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18524 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18524 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18524 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms