Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms