Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms