Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd44P15379 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms