Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lcn2P11672 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lcn2P11672 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lcn2P11672 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lcn2P11672 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lcn2P11672 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lcn2P11672 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lcn2P11672 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn2P11672 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms