Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Itgb1P09055 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms