Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefmP08553 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefmP08553 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefmP08553 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefmP08553 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefmP08553 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefmP08553 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NefmP08553 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefmP08553 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms