Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms