Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
TtrP07309 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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TtrP07309 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtrP07309 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtrP07309 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtrP07309 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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TtrP07309 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtrP07309 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtrP07309 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtrP07309 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtrP07309 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtrP07309 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtrP07309 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtrP07309 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtrP07309 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms