Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms