Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tk1P04184 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tk1P04184 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tk1P04184 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tk1P04184 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tk1P04184 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tk1P04184 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tk1P04184 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tk1P04184 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tk1P04184 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tk1P04184 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tk1P04184 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tk1P04184 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tk1P04184 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tk1P04184 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms