Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms