Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01741 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01741 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01741 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01741 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01741 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01741 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01741 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01741 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01741 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01741 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01741 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01741 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01741 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01741 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01741 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01741 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01741 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01741 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01741 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01741 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms