Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01678 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01678 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01678 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms