Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CcnkO88874 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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