Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tom1O88746 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tom1O88746 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms