Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkcO88445 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms