Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtssO70370 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtssO70370 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms