Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms