Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkbO70126 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkbO70126 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkbO70126 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkbO70126 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms