Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ldb2O55203 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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