Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cbx4O55187 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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