Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms