Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms