Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LatO54957 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LatO54957 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LatO54957 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LatO54957 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LatO54957 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LatO54957 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LatO54957 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LatO54957 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms