Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh16O54909 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms