Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChkaO54804 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms